Лечебные свойства Божьего дерева (и других видов полыней) определяются наличием эфирных масел, дубильных веществ, кумаринов, алколоидов, флавоновых соединений, органических кислот, витаминов и редких металлов. Полынь горькая, чернобыльник, полынь дармина (п. цитварная), и экстрагоновая (тархун) и Божье дерево содержат алколоид абротанин, который в малых дозах - лекарство, а в больших количествах может вызвать отравления. Как всякое лекарственное растение, полынь используют с осторожностью и в допустимых нормах.